Только вперед!

В МГУ создали нейросеть для расшифровки ДНК

Российские учёные из Московского госуниверситета имени Михаила Ломоносова, победившие на конкурсе DREAM 2022, создали и уже первично апробировали отечественную нейросеть LegNet, которая и победила на конкурсе. С её помощью биологи будут отслеживать последовательность нуклеиновой кислоты ДНК, которая в свою очередь влияет на активность генов.

Исследование данного влияния на активность генов в настоящее время является одной из наиболее важных проблем современной генетики. Как считают эксперты, нейросети используемые биологами сейчас, не всегда отвечают требованиям современной микробиологии.

Нейросеть LegNet обучалась на миллионах вариантов последовательностей и соответствующей генной активности. Она была признана наилучшей среди подобных разработок учёных из иных стран по всем номинациям. Статья, посвящённая разработке российской нейросети для биологических задач, была опубликована в авторитетном научном издании Nature Biotechnology.

Каждое 14-ое двудольное растение является генно-модифицированным от природы

Многим, если не всем россиянам, известна аббревиатура «ГМО». Она подразумевает под собой внесение в геном какого-либо растения чужеродных генов. Обычно данный манёвр делается для какой-либо цели, необходимой человеку: повышение урожайности сортов и иммунитета к паразитам, улучшение вкуса и так далее.

Но в обществе отношение к генно-модифицированным продуктам предвзятое. Обычно причиной становится то, что продукты выращиваются с помощью «химии». Но, как оказалось, зачастую, генная модификация продуктов питания – дело рук не человека, а природы. В ходе развития многие растения получают иное ДНК, например, с помощью бактерий.

К таким растениям, модифицированным природой, относится арахис, табак, чай и многие другие. Как выяснили генетики Санкт-Петербургского госуниверситета, каждое 14-ое двудольное растение является генно-модифицированным. Причины этого довольно легко объясняются учёными для большинства растений. В случае с арахисом, то сейчас учёным досконально известны те гены, которые были изначально в нём и приобретённые позже.

В МГУ разобрали механизмы считывания ДНК

Учёные Московского университета имени Ломоносова опубликовали новую статью в WIREs Computational Molecular Science. В ней они разобрали почти 60 различных материалов по теме механизма считывания ДНК. К статье прилагаются интерактивные материалы, по которым можно вкратце ознакомиться с выводами работы.

Сама макромолекула дезоксирибонуклеииновой кислоты была считана ещё два десятка лет назад, но механизм считывания организмом, где также принимают участие молекулы РНК и белков до сих пор остаётся под завесой тайны. Трендом стало изучение движения нуклеосом в самих молекулах ДНК, а также взаимодействие последних с белковыми соединениями.

В научной работе были даны советы по построению компьютерных моделей молекул, содержащих ДНК. Такие молекулы невозможно рассмотреть в обыкновенный оптический микроскоп, а работа с помощью электронного сильно затруднена. Поэтому построение моделей остаётся наиболее удобным способом изучения.